Download
btp436.pdf 265,40KB
WeightNameValue
1000 Titel
  • DiProGB: the dinucleotide properties genome browser
1000 Autor/in
  1. Friedel, Maik |
  2. Nikolajewa, Swetlana |
  3. Sühnel, Jürgen |
  4. Wilhelm, Thomas |
1000 Erscheinungsjahr 2009
1000 Art der Datei
1000 Publikationstyp
  1. Artikel |
1000 Online veröffentlicht
  • 2009-07-15
1000 Erschienen in
1000 Quellenangabe
  • 25(19): 2603–2604
1000 FRL-Sammlung
1000 Copyrightjahr
  • 2009
1000 Lizenz
1000 Verlagsversion
  • https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp436 |
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2752610/ |
1000 Publikationsstatus
1000 Begutachtungsstatus
1000 Sprache der Publikation
1000 Abstract/Summary
  • Motivation: DiProGB is an easy to use new genome browser that encodes the primary nucleotide sequence by thermodynamical and geometrical dinucleotide properties. The nucleotide sequence is thus converted into a sequence graph. This visualization, supported by different graph manipulation options, facilitates genome analyses, because the human brain can process visual information better than textual information. Also, DiProGB can identify genomic regions where certain physical properties are more conserved than the nucleotide sequence itself. Most of the DiProGB tools can be applied to both, the primary nucleotide sequence and the sequence graph. They include motif and repeat searches as well as statistical analyses. DiProGB adds a new dimension to the common genome analysis approaches by taking into account the physical properties of DNA and RNA.
1000 Fachgruppe
  1. Biologie |
  2. Medizin |
1000 Fächerklassifikation (DDC)
1000 Liste der Beteiligten
  1. https://frl.publisso.de/adhoc/creator/RnJpZWRlbCwgTWFpaw==|https://frl.publisso.de/adhoc/creator/Tmlrb2xhamV3YSwgU3dldGxhbmE=|https://frl.publisso.de/adhoc/creator/U8O8aG5lbCwgSsO8cmdlbg==|https://frl.publisso.de/adhoc/creator/V2lsaGVsbSwgVGhvbWFz
1000 Förderer
  1. Leibniz Graduate School for Aging and Age-related Diseases (LGSA) |
  2. BBSRC |
1000 Fördernummer
  1. -
  2. -
1000 Förderprogramm
  1. -
  2. Core Strategic Grant
1000 Dateien
  1. DiProGB: the dinucleotide properties genome browser
1000 Förderung
  1. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Leibniz Graduate School for Aging and Age-related Diseases (LGSA) |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  2. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer BBSRC |
    1000 Förderprogramm Core Strategic Grant
    1000 Fördernummer -
1000 Objektart article
1000 Beschrieben durch
1000 @id frl:6406325.rdf
1000 Erstellt am 2018-01-15T16:58:25.211+0100
1000 Erstellt von 218
1000 beschreibt frl:6406325
1000 Bearbeitet von 218
1000 Zuletzt bearbeitet Fri Sep 28 09:55:09 CEST 2018
1000 Objekt bearb. Fri Sep 28 09:55:09 CEST 2018
1000 Vgl. frl:6406325
1000 Oai Id
  1. oai:frl.publisso.de:frl:6406325 |
1000 Sichtbarkeit Metadaten public
1000 Sichtbarkeit Daten public
1000 Gegenstand von

View source