CAMI 2 - Challenge Datasets

  1. Fritz, Adrian ORCID logo
  2. Lesker, Till ORCID logo
  3. Bremges, Andreas
  4. Willassen, N. P.
  5. Smit, N.
  6. Strowig, T.
  7. Häussler, Susanne ORCID logo
  8. Gastmeier, Petra ORCID logo
  9. Maechler, Friederike
  10. König, R.
  11. Khaledi, A.
  12. Dabrowski, P. W.
  13. Nitsche, A.
  14. Hansen, L. H.
  15. Jørgensen, T. S.
  16. Hacquard, S.
  17. Mesny, F.
  18. Radutoiu, S.
  19. Oter, R. G.
  20. Schulze-Lefert, P.
  21. McHardy, Alice ORCID logo

WeightNameValue
1000 Titel
  • CAMI 2 - Challenge Datasets
1000 Titelzusatz
  • Marine, Strain Madness, Rhizosphere and Clinical pathogen detection challenge datasets
1000 Hinweise zur Nutzung
  • The data can be downloaded via the link https://frl.publisso.de/data/frl:6425521/ under "Zugehöriges Dataset". A direct download function within this metadata record is planned for a later date. This does not affect the integrity of the data. The citation capability is fully ensured.
1000 Autor/in
  1. Fritz, Adrian |
  2. Lesker, Till |
  3. Bremges, Andreas |
  4. Willassen, N. P. |
  5. Smit, N. |
  6. Strowig, T. |
  7. Häussler, Susanne |
  8. Gastmeier, Petra |
  9. Maechler, Friederike |
  10. König, R. |
  11. Khaledi, A. |
  12. Dabrowski, P. W. |
  13. Nitsche, A. |
  14. Hansen, L. H. |
  15. Jørgensen, T. S. |
  16. Hacquard, S. |
  17. Mesny, F. |
  18. Radutoiu, S. |
  19. Oter, R. G. |
  20. Schulze-Lefert, P. |
  21. McHardy, Alice |
1000 Zugehöriges Dataset
1000 Erscheinungsjahr 2020
1000 Art der Datei
1000 Publikationstyp
  1. Forschungsdaten |
1000 FRL-Sammlung
1000 Copyrightjahr
  • 2020
1000 Lizenz
1000 Sprache der Publikation
1000 Sacherschließung
lokal mouse gut
lokal microbiome
lokal CAMI challenge
lokal benchmarking
lokal long read sequence data
lokal Metagenome
lokal short read sequence data
1000 Erhebungsform
1000 Fächerklassifikation (DDC)
1000 DOI 10.4126/FRL01-006425521 |
1000 Beschreibung
  • Simulated short read and long read shotgun metagenome data from samples at different seafloor locations of a marine environment (Marine dataset), samples from the plant-associated microhabitats (i.e. rhizosphere, phycosphere, and endosphere from multiple host species, a.k.a. Rhizosphere dataset), including a large amount of strain-level variation (Strain Madness dataset), and real metagenome data from blood of a human host (anonymized on the human read level) mimicking an emergency diagnostic situation in a clinic (Clinical pathogen detection dataset).
1000 Liste der Beteiligten
  1. https://orcid.org/0000-0002-9853-5577|https://orcid.org/0000-0002-3085-6438|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/QnJlbWdlcywgQW5kcmVhcw==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/V2lsbGFzc2VuLCBOLiBQLg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U21pdCwgTi4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U3Ryb3dpZywgVC4=|https://orcid.org/0000-0001-6141-9102|https://orcid.org/0000-0001-5520-4287|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TWFlY2hsZXIsIEZyaWVkZXJpa2U=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S8O2bmlnLCBSLg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S2hhbGVkaSwgQS4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/RGFicm93c2tpLCBQLiBXLg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Tml0c2NoZSwgQS4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SGFuc2VuLCBMLiBILg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SsO4cmdlbnNlbiwgVC4gUy4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SGFjcXVhcmQsIFMu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TWVzbnksIEYu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/UmFkdXRvaXUsIFMu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/T3RlciwgUi4gRy4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2NodWx6ZS1MZWZlcnQsIFAu|https://orcid.org/0000-0003-2370-3430
1000 Label
1000 Fördernummer
  1. -
1000 Förderprogramm
  1. -
1000 Objektart researchData
1000 Beschrieben durch
1000 @id frl:6425521.rdf
1000 Erstellt am 2021-02-04T12:35:30.085+0100
1000 Erstellt von 122
1000 beschreibt frl:6425521
1000 Bearbeitet von 305
1000 Zuletzt bearbeitet Fri Mar 10 16:36:20 CET 2023
1000 Objekt bearb. Fri Mar 10 16:36:19 CET 2023
1000 Vgl. frl:6425521
1000 Oai Id
  1. oai:frl.publisso.de:frl:6425521 |
1000 Sichtbarkeit Metadaten public
1000 Sichtbarkeit Daten public
1000 Gegenstand von

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