Large-scale genotyping and phenotyping of a worldwide winter wheat genebank for its use in pre-breeding

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1000 Titel
  • Large-scale genotyping and phenotyping of a worldwide winter wheat genebank for its use in pre-breeding
1000 Autor/in
  1. Schulthess Börgel, Albert Wilhelm |
  2. Kale, Sandip |
  3. Zhao, Yusheng |
  4. Gogna, Abhishek |
  5. Rembe, Max |
  6. Philipp, Norman |
  7. Liu, Fang |
  8. Beukert, Ulrike |
  9. Serfling, Albrecht |
  10. Himmelbach, Axel |
  11. Oppermann, Markus |
  12. Weise, Stephan |
  13. Boeven, Philipp H G |
  14. Schacht, Johannes |
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  25. Reif, Jochen |
1000 Erscheinungsjahr 2022
1000 LeibnizOpen
1000 Publikationstyp
  1. Artikel |
1000 Online veröffentlicht
  • 2022-12-26
1000 Erschienen in
1000 Quellenangabe
  • 9(1):784
1000 FRL-Sammlung
1000 Copyrightjahr
  • 2022
1000 Lizenz
1000 Verlagsversion
  • https://dx.doi.org/10.1038/s41597-022-01891-5 |
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9792552/ |
1000 Publikationsstatus
1000 Begutachtungsstatus
1000 Sprache der Publikation
1000 Abstract/Summary
  • Plant genetic resources (PGR) stored at genebanks are humanity's crop diversity savings for the future. Information on PGR contrasted with modern cultivars is key to select PGR parents for pre-breeding. Genotyping-by-sequencing was performed for 7,745 winter wheat PGR samples from the German Federal ex situ genebank at IPK Gatersleben and for 325 modern cultivars. Whole-genome shotgun sequencing was carried out for 446 diverse PGR samples and 322 modern cultivars and lines. In 19 field trials, 7,683 PGR and 232 elite cultivars were characterized for resistance to yellow rust - one of the major threats to wheat worldwide. Yield breeding values of 707 PGR were estimated using hybrid crosses with 36 cultivars - an approach that reduces the lack of agronomic adaptation of PGR and provides better estimates of their contribution to yield breeding. Cross-validations support the interoperability between genomic and phenotypic data. The here presented data are a stepping stone to unlock the functional variation of PGR for European pre-breeding and are the basis for future breeding and research activities.
1000 Sacherschließung
lokal agricultural genetics
lokal phylogenomics
lokal plant breeding
1000 Fächerklassifikation (DDC)
1000 Liste der Beteiligten
  1. https://orcid.org/0000-0002-9365-0939|https://orcid.org/0000-0003-0665-5094|https://orcid.org/0000-0001-6783-5182|https://orcid.org/0000-0002-5990-1829|https://orcid.org/0000-0003-3730-9389|https://orcid.org/0000-0002-9735-9946|https://orcid.org/0000-0002-3774-552X|https://orcid.org/0000-0002-9482-3512|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2VyZmxpbmcsIEFsYnJlY2h0|https://orcid.org/0000-0001-7338-0946|https://orcid.org/0000-0002-3370-3218|https://orcid.org/0000-0003-4031-9131|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Qm9ldmVuLCBQaGlsaXBwIEggRyA=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2NoYWNodCwgSm9oYW5uZXM=|https://orcid.org/0000-0002-0737-1651|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S29sbGVycywgU29uamE=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/UGZlaWZmZXIsIE5pbmE=|https://orcid.org/0000-0003-0760-8249|https://orcid.org/0000-0003-3159-3593|https://orcid.org/0000-0003-4277-9879|https://orcid.org/0000-0002-4316-078X|https://orcid.org/0000-0001-6113-3518|https://orcid.org/0000-0003-3011-8731|https://orcid.org/0000-0001-6373-6013|https://orcid.org/0000-0002-6742-265X
1000 Label
1000 Förderer
  1. Bundesministerium für Bildung und Forschung |
  2. Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft |
  3. Deutsche Forschungsgemeinschaft |
  4. Projekt DEAL |
1000 Fördernummer
  1. 031B0184B; 031B0184A
  2. 2814603813
  3. -
  4. -
1000 Förderprogramm
  1. GeneBank2.0
  2. GenDiv
  3. Open access funding
  4. Open Access funding
1000 Dateien
1000 Förderung
  1. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Bundesministerium für Bildung und Forschung |
    1000 Förderprogramm GeneBank2.0
    1000 Fördernummer 031B0184B; 031B0184A
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    1000 Fördernummer 2814603813
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1000 Objektart article
1000 Beschrieben durch
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1000 Erstellt am 2023-02-09T14:09:06.981+0100
1000 Erstellt von 325
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1000 Bearbeitet von 25
1000 Zuletzt bearbeitet Thu Apr 20 14:57:10 CEST 2023
1000 Objekt bearb. Thu Apr 20 14:57:10 CEST 2023
1000 Vgl. frl:6440216
1000 Oai Id
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1000 Sichtbarkeit Metadaten public
1000 Sichtbarkeit Daten public
1000 Gegenstand von

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