Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential

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1000 Titel
  • Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential
1000 Autor/in
  1. Rabanus-Wallace, Mark Timothy |
  2. Hackauf, Bernd |
  3. Mascher, Martin |
  4. Lux, Thomas |
  5. Wicker, Thomas |
  6. Gundlach, Heidrun |
  7. Baez, Mariana |
  8. Houben, Andreas |
  9. Mayer, Klaus |
  10. Gao, Liangliang |
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  12. Pozniak, Curtis |
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  15. Praz, Coraline R |
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  21. Börner, Andreas |
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  23. Čížková, Jana |
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  54. Ordon, Frank |
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  56. Rakoczy-Trojanowska, Monika |
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  58. Schulman, Alan |
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  60. Stojalowski, Stefan |
  61. Tiwari, Vijay K |
  62. Spannagl, Manuel |
  63. Stein, Nils |
1000 Erscheinungsjahr 2021
1000 LeibnizOpen
1000 Publikationstyp
  1. Artikel |
1000 Online veröffentlicht
  • 2021-03-18
1000 Erschienen in
1000 Quellenangabe
  • 53(4):564-573
1000 FRL-Sammlung
1000 Copyrightjahr
  • 2021
1000 Lizenz
1000 Verlagsversion
  • https://dx.doi.org/10.1038/s41588-021-00807-0 |
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8035072/ |
1000 Ergänzendes Material
  • https://static-content.springer.com/esm/art%3A10.1038%2Fs41588-021-00807-0/MediaObjects/41588_2021_807_MOESM1_ESM.pdf |
1000 Publikationsstatus
1000 Begutachtungsstatus
1000 Sprache der Publikation
1000 Abstract/Summary
  • Rye (Secale cereale L.) is an exceptionally climate-resilient cereal crop, used extensively to produce improved wheat varieties via introgressive hybridization and possessing the entire repertoire of genes necessary to enable hybrid breeding. Rye is allogamous and only recently domesticated, thus giving cultivated ryes access to a diverse and exploitable wild gene pool. To further enhance the agronomic potential of rye, we produced a chromosome-scale annotated assembly of the 7.9-gigabase rye genome and extensively validated its quality by using a suite of molecular genetic resources. We demonstrate applications of this resource with a broad range of investigations. We present findings on cultivated rye’s incomplete genetic isolation from wild relatives, mechanisms of genome structural evolution, pathogen resistance, low-temperature tolerance, fertility control systems for hybrid breeding and the yield benefits of rye–wheat introgressions.
1000 Sacherschließung
lokal genomics
lokal plant genetics
lokal plant breeding
1000 Fächerklassifikation (DDC)
1000 Liste der Beteiligten
  1. https://orcid.org/0000-0002-4663-985X|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SGFja2F1ZiwgQmVybmQ=|https://orcid.org/0000-0001-6373-6013|https://orcid.org/0000-0002-5543-1911|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/V2lja2VyLCBUaG9tYXM=|https://orcid.org/0000-0002-6757-0943|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/QmFleiwgTWFyaWFuYQ==|https://orcid.org/0000-0003-3419-239X|https://orcid.org/0000-0001-6484-1077|https://orcid.org/0000-0002-3864-0631|https://orcid.org/0000-0002-7856-1399|https://orcid.org/0000-0002-7536-3856|https://orcid.org/0000-0002-3866-5038|https://orcid.org/0000-0003-4471-2520|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/UHJheiwgQ29yYWxpbmUgUg==|https://orcid.org/0000-0002-6771-6914|https://orcid.org/0000-0002-2556-2478|https://orcid.org/0000-0003-3283-9233|https://orcid.org/0000-0002-8284-7728|https://orcid.org/0000-0003-4044-4346|https://orcid.org/0000-0003-3301-9026|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/QnlybnMsIEJyb29r|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/xIzDrcW_a292w6EsIEphbmE=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Rm93bGVyLCBEIEJyaWFu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/RnJpdHosIEFsbGFu|https://orcid.org/0000-0001-7338-0946|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S2FpdGhha290dGlsLCBHZW15|https://orcid.org/0000-0002-6792-7076|https://orcid.org/0000-0003-2379-9225|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S29ua2luLCBEYXZpZA==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TGFyc2VuLCBKYW1pZQ==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TGksIFFpYW5n|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TXnFm2vDs3csIEJlYXRh|https://orcid.org/0000-0003-3125-3695|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/UmF3YXQsIE5pZGhp|https://orcid.org/0000-0003-1234-4276|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Qml5aWtsaW9nbHUtS2F5YSwgU2V6Z2k=|https://orcid.org/0000-0002-1832-4009|https://orcid.org/0000-0003-4159-7619|https://orcid.org/0000-0001-5300-1216|https://orcid.org/0000-0002-5453-1013|https://orcid.org/0000-0001-6983-0609|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/VHN2ZXRrb3ZhLCBOYXRhbGlh|https://orcid.org/0000-0003-3423-8511|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/VnLDoW5hLCBKYW4=|https://orcid.org/0000-0002-4820-2846|https://orcid.org/0000-0002-8030-2716|https://orcid.org/0000-0002-6263-0492|https://orcid.org/0000-0002-1806-020X|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SmlhLCBKaXplbmc=|https://orcid.org/0000-0003-0760-8249|https://orcid.org/0000-0002-7778-7396|https://orcid.org/0000-0002-0942-9116|https://orcid.org/0000-0002-1695-6395|https://orcid.org/0000-0003-3530-2626|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/UmFrb2N6eS1Ucm9qYW5vd3NrYSwgTW9uaWth|https://orcid.org/0000-0001-6113-3518|https://orcid.org/0000-0002-4126-6177|https://orcid.org/0000-0002-4885-1918|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U3RvamFsb3dza2ksIFN0ZWZhbg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/VGl3YXJpLCBWaWpheSBL|https://orcid.org/0000-0003-0701-7035|https://orcid.org/0000-0003-3011-8731
1000 Label
1000 Förderer
  1. Bundesministerium für Bildung und Forschung |
  2. Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft |
  3. European Regional Development Fund |
  4. Deutsche Forschungsgemeinschaft |
  5. Czech Science Foundation |
  6. Montana Wheat and Barley Committee |
  7. Noble Research Institute |
  8. Australian Research Council |
  9. Genome Canada and Genome Prairie |
  10. National Research Council Canada’s |
  11. Province of Saskatchewan Agriculture Development Fund |
  12. Bundesamt für Landwirtschaft, Bern |
  13. Narodowe Centrum Nauki |
  14. Agriculture and Agri-Food Canada |
  15. Natural Resources Institute Finland |
  16. Biotechnology and Biological Sciences Research Council |
  17. 2Blades Foundation |
  18. HYBRO Saatzucht GmbH & Co. KG |
  19. Julius Kühn-Institute |
  20. KWS SAAT SE & Co |
1000 Fördernummer
  1. 031A536; 0315946A
  2. 2819103915
  3. CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000827
  4. HO 1779/30-1
  5. 17-17564S
  6. -
  7. -
  8. CE140100008
  9. CTAG2
  10. -
  11. -
  12. PGREL NN-0036
  13. DEC-2015/19/B/NZ9/00921; DEC-2014/14/E/NZ9/0028; 2015/17/B/NZ9/01694
  14. -
  15. -
  16. BB/P016855/1
  17. -
  18. -
  19. -
  20. -
1000 Förderprogramm
  1. de.NBI; RYE-SELECT
  2. WHEATSEQ
  3. plants as a tool for sustainable global development
  4. -
  5. -
  6. -
  7. -
  8. -
  9. -
  10. Wheat Flagship Program
  11. -
  12. -
  13. -
  14. Agri-Innovation Program
  15. Innofood Stategic Funds program
  16. Designing Future Wheat program
  17. -
  18. -
  19. -
  20. -
1000 Dateien
1000 Förderung
  1. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Bundesministerium für Bildung und Forschung |
    1000 Förderprogramm de.NBI; RYE-SELECT
    1000 Fördernummer 031A536; 0315946A
  2. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Bundesministerium für Ernährung und Landwirtschaft |
    1000 Förderprogramm WHEATSEQ
    1000 Fördernummer 2819103915
  3. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer European Regional Development Fund |
    1000 Förderprogramm plants as a tool for sustainable global development
    1000 Fördernummer CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000827
  4. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Deutsche Forschungsgemeinschaft |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer HO 1779/30-1
  5. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Czech Science Foundation |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer 17-17564S
  6. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Montana Wheat and Barley Committee |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  7. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Noble Research Institute |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  8. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Australian Research Council |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer CE140100008
  9. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Genome Canada and Genome Prairie |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer CTAG2
  10. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer National Research Council Canada’s |
    1000 Förderprogramm Wheat Flagship Program
    1000 Fördernummer -
  11. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Province of Saskatchewan Agriculture Development Fund |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  12. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Bundesamt für Landwirtschaft, Bern |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer PGREL NN-0036
  13. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Narodowe Centrum Nauki |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer DEC-2015/19/B/NZ9/00921; DEC-2014/14/E/NZ9/0028; 2015/17/B/NZ9/01694
  14. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Agriculture and Agri-Food Canada |
    1000 Förderprogramm Agri-Innovation Program
    1000 Fördernummer -
  15. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Natural Resources Institute Finland |
    1000 Förderprogramm Innofood Stategic Funds program
    1000 Fördernummer -
  16. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Biotechnology and Biological Sciences Research Council |
    1000 Förderprogramm Designing Future Wheat program
    1000 Fördernummer BB/P016855/1
  17. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer 2Blades Foundation |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  18. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer HYBRO Saatzucht GmbH & Co. KG |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  19. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer Julius Kühn-Institute |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
  20. 1000 joinedFunding-child
    1000 Förderer KWS SAAT SE & Co |
    1000 Förderprogramm -
    1000 Fördernummer -
1000 Objektart article
1000 Beschrieben durch
1000 @id frl:6438472.rdf
1000 Erstellt am 2022-11-17T17:09:17.386+0100
1000 Erstellt von 325
1000 beschreibt frl:6438472
1000 Bearbeitet von 317
1000 Zuletzt bearbeitet 2022-11-22T10:07:03.064+0100
1000 Objekt bearb. Tue Nov 22 10:07:02 CET 2022
1000 Vgl. frl:6438472
1000 Oai Id
  1. oai:frl.publisso.de:frl:6438472 |
1000 Sichtbarkeit Metadaten public
1000 Sichtbarkeit Daten public
1000 Gegenstand von

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