Alterations in the hepatocyte epigenetic landscape in steatosis

  1. Maji, Ranjan Kumar
  2. Czepukojc, Beate
  3. Scherer, Michael
  4. Tierling, Sascha
  5. Cadenas, Cristina ORCID logo
  6. Gianmoena, Kathrin
  7. Gasparoni, Nina
  8. Nordström, Karl
  9. Gasparoni, Gilles
  10. Laggai, Stephan
  11. Yang, Xinyi
  12. Sinha, Anupam
  13. Ebert, Peter
  14. Falk-Paulsen, Maren
  15. Kinkley, Sarah
  16. Hoppstädter, Jessica
  17. Chung, Ho-Ryun
  18. Rosenstiel, Philip
  19. Hengstler, Jan ORCID logo
  20. Walter, Jörn
  21. Schulz, Marcel H.
  22. Kessler, Sonja M.
  23. Kiemer, Alexandra K.

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1000 Titel
  • Alterations in the hepatocyte epigenetic landscape in steatosis
1000 Autor/in
  1. Maji, Ranjan Kumar |
  2. Czepukojc, Beate |
  3. Scherer, Michael |
  4. Tierling, Sascha |
  5. Cadenas, Cristina |
  6. Gianmoena, Kathrin |
  7. Gasparoni, Nina |
  8. Nordström, Karl |
  9. Gasparoni, Gilles |
  10. Laggai, Stephan |
  11. Yang, Xinyi |
  12. Sinha, Anupam |
  13. Ebert, Peter |
  14. Falk-Paulsen, Maren |
  15. Kinkley, Sarah |
  16. Hoppstädter, Jessica |
  17. Chung, Ho-Ryun |
  18. Rosenstiel, Philip |
  19. Hengstler, Jan |
  20. Walter, Jörn |
  21. Schulz, Marcel H. |
  22. Kessler, Sonja M. |
  23. Kiemer, Alexandra K. |
1000 Erscheinungsjahr 2023
1000 LeibnizOpen
1000 Publikationstyp
  1. Artikel |
1000 Online veröffentlicht
  • 2023-07-06
1000 Erschienen in
1000 Quellenangabe
  • 16(1):30
1000 FRL-Sammlung
1000 Copyrightjahr
  • 2023
1000 Lizenz
1000 Verlagsversion
  • https://doi.org/10.1186/s13072-023-00504-8 |
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10324225/ |
1000 Ergänzendes Material
  • https://epigeneticsandchromatin.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13072-023-00504-8#Sec26 |
1000 Publikationsstatus
1000 Begutachtungsstatus
1000 Sprache der Publikation
1000 Abstract/Summary
  • Fatty liver disease or the accumulation of fat in the liver, has been reported to affect the global population. This comes with an increased risk for the development of fibrosis, cirrhosis, and hepatocellular carcinoma. Yet, little is known about the effects of a diet containing high fat and alcohol towards epigenetic aging, with respect to changes in transcriptional and epigenomic profiles. In this study, we took up a multi-omics approach and integrated gene expression, methylation signals, and chromatin signals to study the epigenomic effects of a high-fat and alcohol-containing diet on mouse hepatocytes. We identified four relevant gene network clusters that were associated with relevant pathways that promote steatosis. Using a machine learning approach, we predict specific transcription factors that might be responsible to modulate the functionally relevant clusters. Finally, we discover four additional CpG loci and validate aging-related differential CpG methylation. Differential CpG methylation linked to aging showed minimal overlap with altered methylation in steatosis.
1000 Fächerklassifikation (DDC)
1000 Liste der Beteiligten
  1. https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TWFqaSwgUmFuamFuIEt1bWFy|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Q3plcHVrb2pjLCBCZWF0ZQ==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2NoZXJlciwgTWljaGFlbA==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/VGllcmxpbmcsIFNhc2NoYQ==|https://orcid.org/0000-0003-3374-6418|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/R2lhbm1vZW5hLCBLYXRocmlu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/R2FzcGFyb25pLCBOaW5h|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Tm9yZHN0csO2bSwgS2FybA==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/R2FzcGFyb25pLCBHaWxsZXM=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/TGFnZ2FpLCBTdGVwaGFu|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/WWFuZywgWGlueWk=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2luaGEsIEFudXBhbQ==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/RWJlcnQsIFBldGVy|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/RmFsay1QYXVsc2VuLCBNYXJlbg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S2lua2xleSwgU2FyYWg=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/SG9wcHN0w6RkdGVyLCBKZXNzaWNh|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Q2h1bmcsIEhvLVJ5dW4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/Um9zZW5zdGllbCwgUGhpbGlw|https://orcid.org/0000-0002-1427-5246|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/V2FsdGVyLCBKw7Zybg==|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/U2NodWx6LCBNYXJjZWwgSC4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S2Vzc2xlciwgU29uamEgTS4=|https://frl.publisso.de/adhoc/uri/S2llbWVyLCBBbGV4YW5kcmEgSy4=
1000 Label
1000 Förderer
  1. Goethe-Universität Frankfurt am Main |
  2. Bundesministerium für Bildung und Forschung |
  3. Deutsche Forschungsgemeinschaft |
  4. Deutsches Zentrum für Herz-Kreislaufforschung |
  5. Cardio-Pulmonary Institute |
  6. Hessisches Ministerium für Wissenschaft und Kunst |
1000 Fördernummer
  1. -
  2. O1KU1216F
  3. KI702; 493935791
  4. 81Z0200101
  5. 390649896
  6. -
1000 Förderprogramm
  1. Project DEAL
  2. -
  3. Walter Benjamin Fellowship
  4. -
  5. EXC 2026
  6. LOEWE Research Initiative ACLF-I
1000 Dateien
  1. Alterations in the hepatocyte epigenetic landscape in steatosis
    Alterations in the hepatocyte epigenetic landscape in steatosis
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    1000 Fördernummer -
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1000 Erstellt am 2024-06-24T13:54:44.247+0200
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1000 Bearbeitet von 317
1000 Zuletzt bearbeitet Tue Jun 25 13:37:47 CEST 2024
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1000 Vgl. frl:6483404
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1000 Sichtbarkeit Daten public
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